洪十二年明军占领云南省，二月、向云南等地宣政使司，今治云南昆明。
明政府参照元代云南的设置，按照内地逐渐完善的政区制度对云南进行了政区调整。
洪武年间是云南政区变化最大的时期。
经过一系列的变化，洪武中期以后，云南布政司的州府县主要集中在孟定、元江、临安三府以北，以西以南以各羁辖的宣慰司、宣抚司、安抚司、长官司为主，嘉靖历年来，西南部分土司划归缅甸
明代晚期，云南布政司的府州县又作了调整。
截至崇祯十三年，云南布政司管辖情况如下：
一、府
雲南省
洪武十五年二月设云南府，与元末中庆路管辖相同。
今治云南昆明湖市。
尋甸府
洪武十五年三月原建仁德府，十六年十月改为仁德军民府，后改为寻甸军民府，成化十二年又改为寻甸府。
府于明初设立安氏土知府，成化十二年初设立流官知府。
府旧治位于今云南寻甸自治县东中古城，嘉靖七年十月迁今县治，嘉靖十二年建新城。
臨安府
洪武十五年正月改元临安路，设府。
府治本今云南通海县，洪武于15年正月移治今云南建水县。
澂江府
洪十五年三月将澄江路改为澄江府，管辖范围与原澄江路相同。
府治不断变迁，洪武中迁锈球山顶，弘治中在金莲山，正德十三年迁旸溥山脚下，嘉靖二十年迁金莲山南，隆庆四年迁凤山下，均在今云南澄江县。
広西府
洪十五年三月将广西西路改元广西府，府开始设立昂氏土知府，成化十七年七月设立流官知府。
府治今云南泸西县。
広南府
洪武十五年十二月，改元广西南路宣抚司，设立广南府，认土酋长国的僵朗为同知。
府治今云南广南县。
楚雄府
洪十五年三月设府，府治今云南楚雄市。
武定府
洪武十五年正月将武定路改为武定军民府，设立土知府。
万历中放弃军民，新设流官。
府治位于今云南武定县东旧城，隆庆三年闰六月迁今武定县。
景東府
洪武十五年闰二月设府，三月位于楚雄府景东州，十七年正月也是府。
明代景东府是土府，设有土知府。
今雲南景東自治県治。
府
洪三十五年十二月置镇沅州，直隶云南布政司，永乐四年四月升为府。
明代先后设立刀氏土知州、土知府。
府治位于今云南镇沅自治县旧城。
大理府
洪十五年三月将大理路改为大理府。
现在治理在云南大理市。
永寧府
洪武十五年三月设永宁州，属北胜府。
十七年州改为鹤庆府，二十九年改为澜沧卫。
永乐四年四月升府。
明代阿氏土知州、土知府相继出现。
今治云南省宁蒗县西北永宁。
蒙化府
洪武十五年三月设蒙化州，属大理府。
正统的13年晋升为政府。
明代先后设立土知州、土知府。
今雲南巍山自治県治。
顺宁府
洪武十五年三月设顺宁府，后降为顺宁州，十七年又升为府。
府设有猛氏土知府，万历中改设流官。
府治在今云南凤庆县。
二、军民府
曲靖军民府
洪武十五年三月设立，明代曲靖府是在元曲靖路基础上设立的。
洪武二十七年升为军民府。
府治在今云南曲靖市。
元江军民府
洪武十五年三月设元江府，永乐三年七月改为军民府。
明代设有那氏土知府。
府治在今云南元江自治县。
姚安军民府
洪武十五年三月改元姚安路为府，二十七年四月改为军民府。
府治在今云南姚安县。
鹤庆军民府
洪武十五年三月设鹤庆府，三十年十一月改为军民府。
府治在今云南鹤庆县。
府在明代设有高氏土知府，正统八年十月改用流官。
丽江军民府
洪武十五年三月设丽江府，三十一年十一月改为军民府，丽江府在明代设有木氏土知府，府治在今云南丽江市。
永昌军民府
洪武十五年三月为永昌府，是二十三年十二月，废府，所属地并入金齿军民府。
嘉靖余年十月废金齿军民府，重置永昌军民府，府治在今云南保山市。
三、御夷府
孟定御夷府
元至元三十年四月设置，洪武十五年三月该元孟定路为孟定府，后废，洪武三十五年十二月复置。
治在今云南耿马自治县西孟定。
孟艮御夷府
永乐三年七月设置，直隶云南都司，后直隶布政司。
府设土知府。
治在今缅甸掸邦景栋。
四、直隶州、御夷州
北胜直隶州
洪武十五年三月设北胜府，属云南布政司。
洪武十七年降为州。
正统七年直隶布政司。
明代设有高氏土知州。
治本在今云南永胜县北旧州城，弘治九年迁今永胜县城。
威远御夷州
元威远州，属威楚路，后改威远蛮棚府，洪武十五年三月仍为威远州，属楚雄府。
十七年升为府，后废。
三十五年十二月复置州，直隶布政司。
州、府皆设土官。
治在今云南景谷县。
湾甸御夷州
洪武十七年，置湾甸县，永乐元年正月废，析麓川平甸地置湾甸长官司，直隶都司。
三年四月升为州，直隶布政司。
设有刀姓土知州。
治在今云南昌宁县西南湾甸。
镇康御夷州
元镇康路。
洪武十五年三月为府。
十七年降为直隶州。
永乐三年四月裁入湾甸州。
永乐七年七月复置，直隶布政司。
设有刀姓土知州。
州治资金云南永德县东北永康旧城。
五、宣慰司
车里军民宣慰司
洪武十五年闰二月，改元车里路为车里军民府。
十七年八月改军民宣慰使司。
永乐中废。
宣德六年重置。
治在今云南景洪市。
缅甸军民宣慰使司
洪武二十七年六月，置缅中宣慰使司，寻废。
永乐元年十月复置，改为缅甸军民宣慰使司。
治在今缅甸阿瓦。
木邦军民宣慰使司
洪武十五年三月，改元木邦路为木邦府，后废。
三十五年十二月复置。
永乐二年六月改军民宣慰使司。
治在今缅甸新维。
八百大甸军民宣慰使司
洪武二十四年六月，改元八百等处宣慰使司为八百大甸军民宣慰使司。
治在今泰国清迈。
老挝军民宣慰使司
永乐二年四月置。
治在今老挝琅勃拉邦。
大古剌军民宣慰使司
永乐四年六月置。
治在今缅甸勃固。
底马撒军民宣慰使司
永乐四年六月置。
治在今缅甸勃固东南毛淡棉。
底兀剌宣慰使司
永乐二十二年三月置。
治在今缅甸勃固西北。
南甸宣慰使司
洪武十五年三月改元南甸路为南甸府，后废。
永乐十二年正月置州，直隶布政司，设有土知州。
正统三年五月改属金齿军民指挥使司。
九年六月升宣抚司，仍直隶布政司。
治本在今云南梁河县与腾冲县交界处的大地，正统九年十二月迁于今梁河县九保街。
六、宣抚司
干崖宣抚司
洪武十五年三月改元镇西路为镇西府，后废。
永乐元年正月析置干崖长官司，直隶都司，后属金齿军民指挥使司。
宣德五年六月复属都司。
正统三年五月复属金齿军民指挥使司，九年六月升宣抚司，直隶布政司。
治在今云南盈江县城关。
陇川宣抚司
正统九年置陇川宣抚司。
治陇把，在今云南陇川县西南弄巴。
孟密宣抚司
元为孟并长官司，成化二十年六月析木邦地置孟密安抚司，直隶布政司，后改隶木邦军民宣慰使司，弘治六年八月仍改直隶云南布政司。
万历十三年五月，升孟密安抚司为宣抚司。
治在今缅甸掸邦西北蒙米特。
七、长官司
钮兀御夷长官司
宣德八年十月以河泥之钮兀、五隆两寨置，治在今云南江城县。
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