在现代农业生产过程中，化肥的使用在其中可以说起着非常重要的作用。 合理使用化肥有利于农作物增产，但过度追求产量、过度使用化肥会导致土壤性质恶化、土壤肥力下降等问题.
化肥过量施用会导致土壤性状恶化、产品质量下降、环境污染等问题。
化肥多由多种盐类组成，氮、磷、钾等部分化学物质容易固结在土壤中，在土壤中积累。
过量施用化肥会造成土壤酸化和土壤板结导致耕地土壤退化，土壤酸化会增加铝、锰、镉、汞、铅等有害重金属元素在土壤中的活性，造成重金属污染；
溶解土壤中的一些营养物质，如钾、钙、镁等，使营养成分流失，影响作物生长；
化肥施用过多会减弱农作物对病虫害的抵抗力，容易受到病虫害的侵害，增加防治病虫害的农药使用量，直接威胁食品安全，食用被污染的农产品，会影响和危害人类健康，诱发多种疾病。
目前化肥生产主要依靠天然气、煤炭、磷矿石，这些都是我国紧缺的资源，过量施用化肥也导致生产原料资源短缺。
另外，在选择化肥的时候，也建议使用有机化肥！
凡是以有机物质(含碳化合物)为肥料的都叫有机肥。
包括粪尿、厩肥、堆肥、绿肥、饼肥、沼气肥等。
具有种类多、来源广、肥效长等特点。
有机肥中的营养素大多呈有机状态，难以直接利用作物。 在微生物的作用下，缓慢释放出大量的营养物质，不断地为作物提供养分。
有机肥营养元素齐全，能改良土壤、提高产品质量、改善作物根际微生物群、提高植物抗病虫能力、促进化肥利用、提高化肥利用率
当然，有机肥也不能过于集中，也不能过量施用。
有机肥一般含碳量高、含氮量少，但施用过量，容易造成作物前期缺氮和幼苗不育。
因此，有机肥并不是越多越好，一般每亩施用1000-1500公斤或绿肥1000-1500公斤，施用时加入适量碳铵或尿素调节碳氮比，防止微生物争氮。
有机肥必须腐烂。 这没怎么解释。
菜田每亩4000~5000kg，严格控制果树斤果斤肥等施肥量；
与菌肥配合使用，既能加速有机肥中有机质的分解，又能分解转化有机肥中的一些有害物质，起到改土、护根、提高植株抗逆性的作用。